پیش ثبت‌نام دوره NGS بالینی آغاز شد …

PubMed چیست؟ معرفی و آموزش PubMed

PubMed یک پایگاه داده غنی و قدرتمند است که به عنوان یکی از معتبرترین منابع برای دسترسی به مقالات علمی در حوزه پزشکی و زیست‌شناسی شناخته می‌شود. این پایگاه توسط کتابخانه ملی پزشکی ایالات متحده (NLM) اداره می‌شود و به صورت رایگان در دسترس عموم قرار دارد. در‌ این آموزش کوتاه شیوه استفاده از PubMed و PMC به صورت گام‌به‌گام بررسی شده است.
معرفی پاب‌مد

فهرست مطالب این نوشتار

مقدمه‌ای بر PubMed و جایگاه آن در پژوهش‌های علمی

PubMed (پاب‌مد) یکی از مهم‌ترین پایگاه‌های داده برای جستجوی مقالات علمی در زمینه زیست‌پزشکی و علوم زیستی است که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) و کتابخانه ملی پزشکی آمریکا (NLM) ایجاد و مدیریت می‌شود. پاب‌مد دسترسی به بیش از ۳۰ میلیون مقاله و گزارش علمی را فراهم می‌کند و به دانشمندان، زیست‌شناسان و دانشجویان این امکان را می‌دهد که دسترسی هدفمند به مقالات معتبر داشته باشند و نتایج پژوهش‌های خود را با سایر محققان به اشتراک بگذارند.

آموزش پاب‌مد

فیلم آموزش گا‌به‌گام PubMed

تاریخچه و تحول PubMed

پایگاه داده PubMed برای اولین بار در سال ۱۹۹۶ معرفی شد و هدف آن فراهم آوردن دسترسی آسان به مقالات علمی و تحقیقات معتبر در زمینه‌های زیست‌شناسی و زیست‌پزشکی بود. قبل از ایجاد پاب‌مد، دسترسی به مقالات و منابع علمی تنها از طریق اشتراک در مجلات چاپی و کتابخانه‌ها ممکن بود، اما با راه‌اندازی این پایگاه، انقلابی در دسترسی آزاد به دانش به وجود آمد. پاب‌مد از ابتدا به تدریج به روزرسانی و گسترش یافت و به ویژه پس از افزودن امکان دسترسی به مقالات رایگان (PubMed Central یا PMC)، استفاده از این پایگاه داده به شکل چشمگیری افزایش یافت.

ساختار و معماری پاب‌مد

ساختار PubMed شامل چندین بخش کلیدی است که به کاربران اجازه می‌دهد مقالات علمی را بر اساس نیازهای خود جستجو و فیلتر کنند. یکی از اصلی‌ترین اجزای این ساختار، اصطلاحات MeSH (Medical Subject Headings) است که یک سیستم طبقه‌بندی سازمان‌یافته از مفاهیم پزشکی و زیستی است و به کاربران کمک می‌کند تا موضوعات خاص را به طور دقیق‌تری جستجو کنند.

پیشنهاد: در دوره بیوانفورماتیک عمومی و کاربردی تمامی بخش‌های NCBI از جمله PubMed، PMC و MeSH به صورت کاملا عملی و گام‌به‌گام آموزش داده شده است.

اصطلاحات MeSH، به صورت سلسله‌مراتبی سازمان‌دهی شده و هر ساله به‌روز می‌شوند تا شامل مفاهیم جدید و تغییرات علم پزشکی باشند. همچنین، PubMed شامل مجموعه‌ای از فیلترها و ابزارهای جستجو برای محدود کردن نتایج به موضوعات خاص، سال انتشار، نوع مقاله و سایر موارد است که به کاربران کمک می‌کند تا به سرعت به اطلاعات مورد نیاز خود دست یابند.

ابزارهای پاب‌مد برای مدیریت اطلاعات و شخصی‌سازی

پاب‌مد ابزارهای متعددی برای مدیریت اطلاعات و شخصی‌سازی ارائه می‌دهد که MyNCBI یکی از مهم‌ترین آن‌هاست. MyNCBI به کاربران اجازه می‌دهد که پروفایل شخصی خود را ایجاد کرده و تنظیمات خاصی برای جستجوها، فیلترها، و هشدارهای اطلاعاتی داشته باشند. کاربران می‌توانند به راحتی مقالات را در MyNCBI ذخیره کرده و برای دسترسی بعدی و سریع به آن‌ها برگردند. این ویژگی، به ویژه برای پژوهشگرانی که در زمینه‌های تخصصی و با حجم زیادی از اطلاعات سروکار دارند، بسیار مفید است.

مزایای استفاده از پاب‌مد در مقایسه با دیگر پایگاه‌های علمی

یکی از ویژگی‌های برجسته PubMed، رایگان بودن دسترسی به اطلاعات آن است. در حالی که بسیاری از پایگاه‌های علمی برای دسترسی به مقالات خود هزینه اشتراک دارند، پاب‌مد بسیاری از مقالات را از طریق پایگاه داده PubMed Central به صورت رایگان در اختیار کاربران قرار می‌دهد. همچنین، گستردگی و تنوع محتوای آن، پاب‌مد را از سایر منابع علمی متمایز می‌کند. این پایگاه نه تنها مقالات تحقیقاتی، بلکه مقالات مروری، گزارش‌های موردی، و حتی نامه‌های علمی را نیز شامل می‌شود و این تنوع به پژوهشگران کمک می‌کند تا به دیدی جامع‌تر از موضوعات مورد نظر خود دست یابند.

پاب‌مد و نقش آن در انتشار تحقیقات علمی

در عصر فناوری اطلاعات، به اشتراک‌گذاری و دسترسی به تحقیقات علمی نقش مهمی در توسعه علم ایفا می‌کند. PubMed به عنوان یک ابزار قدرتمند و قابل اعتماد، نه تنها امکان دسترسی به تحقیقات معتبر را فراهم می‌کند، بلکه به ترویج و انتشار دانش جدید در سطح جهانی کمک می‌کند. بسیاری از پژوهشگران، مقالات خود را در مجلاتی منتشر می‌کنند که در PubMed نمایه می‌شوند، و این امر به اعتبار و دیده‌شدن پژوهش‌ها کمک شایانی می‌کند.

PubMed Central: یک گام به سوی دسترسی آزاد

یکی از پیشرفت‌های مهم در زمینه دسترسی به مقالات علمی، ایجاد PubMed Central (PMC) بود. PMC یک مخزن دیجیتال از مقالات علمی رایگان است که به صورت عمومی در دسترس قرار دارد. ایجاد PMC به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا بدون هیچ هزینه‌ای به مقالات دسترسی داشته باشند. این رویکرد در راستای حرکت جهانی به سمت دسترسی آزاد به دانش (Open Access) بوده و توانسته است به میزان زیادی به گسترش دانش و تحقیقات علمی کمک کند. از آنجا که دسترسی به اطلاعات علمی برای بسیاری از کشورهای در حال توسعه دشوار است، PMC به عنوان یک منبع حیاتی برای دسترسی به مقالات علمی در این کشورها محسوب می‌شود. از طریق لینک زیر می‌توانید به پایگاه PMC وارد شوید:

آموزش استفاده از پایگاه PubMed:

ابتدا با استفاده از دکمه فوق به پایگاه پاب‌مد وارد می‌شویم، در ادامه با یک مثال نحوه استفاده از پایگاه PubMed را بررسی می‌کنیم:

عبارت مدنظر را در کادر جستجو وارد می‌کنیم، در این جا قصد داریم تمامی مقالات مرتبط با COVID 19 را جستجو کنیم:

با استفاده از فیلترهای سمت چپ می‌توانیم نتایج جستجو را شخصی‌سازی نماییم. با اعمال فیلتر زمان انتشار می‌توانید نتایج را به محدوده زمانی خاصی فیلتر کنید. همچنین نتایج بر اساس این که مقاله کامل یا خلاصه مقاله در پایگاه PubMed موجود هست یا خیر قابل محدود کردن است. با زدن تیک Free full text می‌توانیم مقالاتی را که متن کامل آن‌ها در قالب PDF موجود است را در نتایج جستجو محدود کنیم. فایل کامل این مقالات از پایگاه PMC با لینک مستقیم قابل دانلود هستند.

کاربردهای پاب‌مد در آموزش و پژوهش

PubMed به عنوان یک منبع آموزشی نیز کاربردهای فراوانی دارد. دانشجویان و استادان می‌توانند از این پایگاه داده برای دسترسی به منابع علمی معتبر و به‌روز استفاده کنند و در تحقیقات خود به‌کار ببرند. پاب‌مد به مدرسین این امکان را می‌دهد که دانشجویان را با تحقیقات و مقالات معتبر آشنا کرده و به آنان اصول پژوهش و ارزیابی مقالات علمی را بیاموزند.

چالش‌ها و محدودیت‌های PubMed

با وجود تمام مزایای PubMed، این پایگاه داده نیز با چالش‌هایی همراه است. یکی از مشکلات اصلی آن، محدودیت دسترسی به مقالاتی است که به صورت رایگان در دسترس نیستند. با این که PubMed Central دسترسی به بسیاری از مقالات را رایگان کرده است، اما همچنان برخی مقالات با محدودیت‌های اشتراکی همراه هستند. همچنین، کاربرانی که با PubMed آشنایی کافی ندارند، ممکن است در جستجوی دقیق و استفاده از فیلترهای مناسب دچار مشکل شوند.

نتیجه‌گیری

PubMed با توجه به ویژگی‌ها و ابزارهای منحصر به فرد خود، به یکی از مهم‌ترین پایگاه‌های داده برای پژوهش‌های زیستی و دست‌یابی به مقالات علمی تبدیل شده است. این پایگاه با فراهم کردن دسترسی رایگان به اطلاعات معتبر و مقالات علمی، و پروتکل‌های زیستی نقش مهمی در توسعه و پیشرفت علم ایفا می‌کند. با توجه به نقش حیاتی این پایگاه در انتشار دانش و اطلاعات علمی، فراگیری استفاده دقیق و حرفه‌ای از آن برای هر پژوهشگر، دانشجو و استادی ضروری است. اگر تجربه استفاده از PubMed و PMC رو دارید خوش‌حال میشیم این تجربیات رو در بخش نظرات با ما به اشتراک بگذارید.

سوالات متداول:

چگونه در PubMed جستجو کنیم؟

برای جستجو در PubMed می‌توانید از کلمات کلیدی، عبارات، یا اصطلاحات MeSH (Medical Subject Headings) استفاده کنید. اصطلاحات MeSH عبارات استاندارد شده‌ای هستند که برای توصیف موضوعات پزشکی به کار می‌روند. با استفاده از عملگرهای بولین (AND، OR، NOT) می‌توانید نتایج جستجوی خود را دقیق‌تر کنید.

آیا دسترسی به PubMed رایگان است؟

بله، دسترسی به PubMed کاملاً رایگان است. هر کسی با اتصال به اینترنت می‌تواند از آن استفاده کند.

تفاوت بین PubMed و PubMed Central چیست؟

PubMed: یک پایگاه داده کتابشناختی است که به اطلاعات توصیفی مقالات (مانند عنوان، نویسندگان، مجله، تاریخ انتشار و چکیده) دسترسی می‌دهد.
PubMed Central: یک آرشیو دسترسی آزاد است که متن کامل مقالات را به صورت رایگان در اختیار عموم قرار می‌دهد. بسیاری از مقالاتی که در PubMed نمایه شده‌اند، نسخه متن کامل آن‌ها در PubMed Central نیز موجود است.

چگونه می‌توانم از PubMed برای انجام یک مطالعه سیستماتیک استفاده کنم؟

PubMed ابزاری بسیار مفید برای انجام مطالعات سیستماتیک است. با استفاده از استراتژی‌های جستجوی دقیق و فیلترهای مختلف، می‌توانید مقالات مرتبط با موضوع مطالعه خود را شناسایی و ارزیابی کنید.

پروفایل گروه بیوانفورماتیک وانیار
تیم تولید محتوای وانیار:

تیم تولید محتوای گروه بیوانفورماتیک وانیار در تلاش است تا بهترین آموزش‌های کوتاه در زمینه بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی را تهیه نماید. صحت محتوای این صفحه توسط کارشناسان گروه بیوانفورماتیک وانیار بررسی شده است.

جدیدترین آموزک‌های بیوانفورماتیک

عضویت در مجله وانیار

جدید ترین مقالات در ایمیل شما!

با عضویت در مجله بیوانفورماتیک وانیار ، برترین مقالات را در ایمیل خود دریافت کنید.

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

هر گونه سوالی دارید، تیم ما آماده پاسخگویی می‌باشد.

برای برقراری ارتباط بر روی آیکن مورد نظر کلیک کنید. پشتیبانی 24/7